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Hieff NGS™ MaxUP II DNA Library Prep Kit  ——文库转化率高达60%,极其适用FFPE、cfDNA样本

——建库试剂盒中的全能王


图片2.jpg

 

1、产品概述

Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®,可用于NGS测序中DNA样本文库构建,采用高质量的酶学组成,改进型接头连接技术,以及具有强扩增效率的高保真酶,显著提高文库转化率与扩增效率,Input DNA范围为500 pg-1 μg,适用包含cfDNA、FFPE在内的所有样本进行文库构建,产品可以应用于全基因组测序、靶向捕获测序、Chip-seq等测序方法中。

2、产品特点

 
适用样本类型广:包含cfDNA、FFPE在内的所有样本均能获得优异文库和测序质量

应用范围广:产品可应用于全基因组测序、靶向捕获测序、Chip-seq等等

高品质酶学组成:业界领先的接头连接效率,高达60%、超高保真性和超强扩增效率

品质稳定:严格的批次性能与稳定性质控


3、操作流程

精简的操作步骤,2-2.5小时快速建库

image.png

 

4、产品优势

1)文库转化效率高达60%

image.png

 

图1  Agilent  2100 检测350bp平末端DNA片段单端和双端连接产物峰

0:350bpDNA片段峰、1:单端接头连接产物峰、2:双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准 protocol进行。

image.png 

2 接头连接效率百分比(%)。

对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%

2)扩增效率高,兼容不同GC含量样本

使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增,效率更高。

产品名称

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super Canace® High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

1 ng GC含量分别为38%、50%、70%的400 bp DNA片段为起始样本,12 cycles扩增。

3)文库产量高

样本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K* 品牌

150

1100

100

1080

以FFPE和cfDNA为起始样本建库,相对同类型试剂盒品牌 K*,在相同扩增循环数下,获得更多文库产量。

4)数据无偏好性

在不同GC含量样本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。

样本

Mapped Reads (%)

Coverage (%)

Average

10×

15×

20×

蜡状芽孢杆菌(GC 34%)

93.8

99.644

99.643

99.641

99.639

99.638

大肠杆菌(GC 51%)

92.7

93.057

92.782

92.687

92.625

92.579

嗜盐杆菌(GC 65%)

94.2

99.598

99.028

98.391

97.885

97.419

image.png

 

图3不同GC含量样本测序偏好性图谱

5、客户反馈

5.1建库产量高

1)杭州某生物公司迈*

洗相同条件下对比实验,脱体积32 μL,对比文库产量,翊圣MaxUpII文库产量比K*文库产量更高


MaxUp II

K* Hyper

Input DNA

50 ng

25 ng

10 ng

50 ng

25 ng

10 ng

循环数 (cycles)

7

9

13

7

9

13

文库浓度 (ng/µL)

15.4

23.8

58.2

8.76

13.5

52.4
 


 image.png

  图4 对比文库质量峰图,翊圣MaxUpII文库主峰单一,大小与目的片段的大小一致,K*品牌建库试剂盒出现多峰的现象

2)北京某基因技术有限公司中*

gDNA样本(NA12878),平行实验中,翊圣建库试剂盒MaxUpII与K*品牌对比,文库质量和产量基本一致,在捕获建库中能兼容不同的捕获试剂!

样本名称

Pre试剂盒

Pre-pcr酶

起始投入量(ng)

Pre-pcr循环数

Pre-pcr浓度(ng/μL)

杂交捕获试剂

Post-pcr循环数

Post-pcr浓度(ng/μL)

K1

K*

K*

100

9

116

SureSelect XT

11

3.62

K2

K*

K*

100

9

116

自制

11

5.58

Y1

YEASEN

K*

100

9

96

SureSelect XT

11

2.98

Y2

YEASEN

K*

100

9

95.2

SureSelect XT

11

2.62

Y3

YEASEN

K*

100

9

99.6

自制

11

6.14

Y4

YEASEN

K*

100

9

96.4

自制

11

4.88

5.2文库对应测序更为准确

1)上海某医学检验所渥*

Input DNA

ctDNA


ctDNA


Library Prep Kit

K* Hyper


Yeasen MaxUp II


Adapter

K*


Yeasen


Clean Beads

AMPure XP


Yeasen


Panel

homemade (0.7 M)

肿瘤用药相关的区域

homemade (0.7 M)

肿瘤用药相关的区域

Target enrichment Kit

Roche NimbleGen


Roche NimbleGen


Number of reads

69,584,944


84,254,863


Mapped reads

69,443,695

99.80%

84,061,118

99.77%

Duplicate Reads skipped

33,619,961

48.31%

36,539,873

43.37%

Region size/percentage of reference

603,967

0.02%

603,967

0.02%

Mapped reads(in region)

37,974,721

54.57%

46,955,235

55.73%

Duplicated Reads(in region)

23,393,464

61.60%

28,074,535

59.79%

Unduplicated mapped reads(in region)

14,581,257

20.95%

15,831,372

18.79%

Coverage Mean

30,324,926


32,898,505


Insert size P25/Median/P75

155/170/192


153/168/188


image.png

 

图5 K*品牌与翊圣MaxUpII建库试剂盒测序数据对比柱状图

 

订购信息

产品

货号

规格

价格(元)

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®

12200ES08/24/96

8/24/96libraries

2456/6486/23567

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类别

名称

货号

规格

价格(元)

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12608ES24/96

24/96 T

2066/6166

连接模块

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Ligation Module

12607ES24/96

24/96 T

2933/9773

扩增模块

2×Super Canace® II High-Fidelity Mix for Library Amplification

12621ES24/96

24/96 T

583/1783

接头

完整接头

Hieff  NGS® Complete Adapter Kit

for Illumina,

12615/6/7/8ES04/16

12×4/12×16 T

1256/4536

短接头

Hieff NGS®  96 Single Index Primer Kit for Illumina®

12611/2ES02

48×2 T

1493

Hieff NGS®   384 Dual Index Primer Kit for Illumina®

12613/4ES02

96×2 T

2753

磁珠

DNA分选

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12601ES56/75

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